皇帝九族的宗族名册，并按时撰写帝王谱系，记录宗室成员子女的嫡庶、名称封号、嗣职袭位、生卒年间、婚嫁、丧葬谥号等事。凡是宗室陈述请求，均为之向皇上汇报，并引荐贤才、记录得失等。刘修为宗人令。宗人令为正一品，下设左右宗正各一人，从一品。

在朝臣设置方面，重置三公，荀彧为司空，张昭为司徒。同时仿效明朝六部为全国行政中心。吏部有尚书一人，左右侍郎各一人，下设四个清吏司（文选、验封、稽勋、考功），每司各有郎中一人，员外郎一人，主事一人等官。吏部职权特重，为六部之首。

户部有尚书一人，左右侍郎各一人，下设十五清吏司（十几只有益州、梁州、交州、广州、扬州、荆州在刘琮掌控下的州郡发挥作用），各司有郎中、员外郎、主事等官。户部另有一些直辖机构，如宝钞提举司、印钞局、广盈库、军储仓等。荀彧为户部尚书。

礼部有尚书一人，左右侍郎各一人，下设四个清吏司（仪制、祀祭、主客、精膳），各司有郎中、员外郎、主事等官。另辖铸印局等。许靖为礼部尚书。兵部有尚书一人，左右侍郎各一人，下设四个清吏司（武选、职方、车驾、武库），各司有郎中、员外郎、主事等官。另辖会文馆等机构。文聘为兵部尚书。

刑部有尚书一人，左右侍郎各一人，下设十三清吏司（分司同户部）。各司有郎中、员外郎、主事等官。工部有尚书一人，左右侍郎各一人，下设四个清吏司（营缮、虞衡、都水、屯田），各司有郎中、员外郎、主事等官。另辖宝源局、军器局等机构。诸葛亮为工部尚书。